Podporujeme nadějné talenty

Rychlá a spolehlivá detekce mikrobiálních patogenů je ve veterinární medicíně základním předpokladem pro včasnou diagnostiku, volbu terapie i hodnocení zdravotního stavu hospodářských i domestikovaných zvířat. Současné metody založené především na kultivaci přináší časovou i finanční náročnost. Spolu se zvyšující se potřebou efektivní diagnostiky narůstá i potřeba zavedení inovativních molekulárně biologických postupů i do prostředí veterinární medicíny. Metoda LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) umožňuje amplifikaci nukleové kyseliny (DNA/RNA) za izotermálních podmínek při konstantní teplotě, tedy probíhá za mnohem jednodušších podmínek v rychlejším čase, a patří tak k nejslibnějším metodám molekulární biologie aplikovatelných do veterinární praxe. Náplní projektu bude vývoj a optimalizace metody LAMP pro detekci významných veterinárních patogenů, s cílem zavedení metody do rutinní praxe v podobě komerčně dostupného produktu.

Microbot-Array technologie je skvělým nástrojem pro moderní multiplexní diagnostiku. Cílem práce je zvýšení citlivosti stávající MBA metody pro využití v laboratorní diagnostice vysoce specifických parametrů v oblasti infekční sérologie a imunologie, včetně možnosti přípravy customizovaných panelů dle požadavků z oblasti personalizované medicíny. Náplní práce bude vývoj a optimalizace procesu vazby rekombinantních antigenů na nanočástice s cílem aplikovat tuto technologii pro vývoj MBA metod pro rutinní praxi v podobě komerčně dostupných produktů.

Cílem diplomové práce je optimalizovat kultivační podmínky eukaryotních buněčných linií CHO a HEK 293 a porovnání velikosti exprese rekombinantních proteinů získaných kultivací v těchto liniích.

Dyslipidémie je jednou z hlavních příčin kardiovaskulárních onemocnění způsobených aterosklerotickým procesem. Hlavním cílem hypolipemické terapie je zásadně zpomalit, zastavit progresi aterosklerotických změn, nebo dokonce navodit jejich regresi. Příznivý vliv na prognózu pacientů má výrazné snížení LDL cholesterolu, které odráží pokles počtu cirkulujících aterogenních LDL částic. Konzervativní léčbou však poměrně velká část pacientů nedosahuje požadovaného snížení na cílové hodnoty. V takových případech je používána léčba inhibitory proprotein konvertázy subtilisin kexin 9 (PCSK9), které které blokují enzym PCSK9 zodpovědný za degradaci LDL receptorů v buňce, a tím je snížena jejich degradace. Tyto receptory tak mohou recirkulovat na povrch buňky, čímž se zvyšuje odbourávání LDL cholesterolu z plazmy a dochází k poklesu plazmatických koncentrací celkového LDL cholesterolu. V klinické diagnostice je základním kontrolním parametrem účinnosti léčby přímé stanovení LDL cholesterolu nebo výpočet dle Friedewaldovy rovnice, které pro hypolipidemické terapie PCSK9 inhibitorů je vhodné rozšířit o imunochemické metody stanovení hladiny samotného PCSK9 v krvi. Téma diplomové práce souvisí se zavedením nových biotechnologií a zajištění řádného biotechnologického postupu pro vývoj a následnou výrobu diagnostických souprav pro stanovení PCSK9, které představují přínos pro lékaře i pacienty. Student prokáže schopnost své výsledky aplikovat a zasadit do požadavků partnera ve výrobní a komerční biotechnologické sféře. Práce bude probíhat ve spolupráci s firmou BioVendor - Laboratorní medicína a.s. v Brně, kde na základě průzkumu trhu byl identifikován potencionální prostor pro nový produkt.

Lidské tělo je každý den vystavováno nespočtu faktorů, které ovlivňují dynamickou rovnováhu střevního mikrobiomu. Cílem diplomové práce bude sledovat a popsat faktory ovlivňující složení lidského střevního bakteriomu. Kromě zdravotního stavu bude cílem zmapovat korelaci základních environmentálních proměnných a složení bakteriální komunity lidského střeva. Diplomant bude obeznámen s kompletním procesem analýzy střevního mikrobiomu od zpracování primárního vzorku, přes amplikonové sekvenování genu 16S rRNA, až po interpretaci taxonomických výsledků, včetně statistické vyhodnocení tohoto typu mnohorozměrných dat.