Menu

Next Generation Sequencing (NGS)

Rychlá, efektivní a dostupná sekvenace – od nukleových kyselin po celé genomy.

Tisíce až miliony zpracovávaných sekvencí současně. Různé vzorky, různí pacienti – NGS přináší revoluci v rychlosti a efektivitě laboratorní diagnostiky. Kompletní kity v jediné zkumavce dělají práci laborantů jednodušší a efektivnější než kdy dříve.

Next Generation Sequencing (NGS)

Molekulární diagnostika je nejrychleji rostoucím segmentem in vitro diagnostického trhu a sekvenování nové generace (NGS) poskytuje hlavní technologickou platformu pro nejmodernější screening genomů pacientů. NGS ve spojení s následnými bioinformatickými analýzami umožňuje vysokovýkonnou detekci změněných genomových oblastí a poskytuje nepřeberné množství klinicky relevantních údajů, což usnadňuje diagnostiku a umožňuje personalizaci léčby.

Během pracovního postupu v laboratoři je spojení knihoven NGS připravených z několika jednotlivých vzorků následováno masivním paralelním sekvenováním, které generuje miliony až miliardy sekvenčních čtení, čímž se vytváří velké množství dat pro výpočetní zpracování a bioinformatickou analýzu.

Abychom podpořili diagnostické pracovní postupy našich zákazníků, poskytujeme komplexní řešení skládající se ze zjednodušeného protokolu laboratorního pracovního postupu v kombinaci se snadno použitelnou intuitivní bioinformatickou analýzou.

Onkologické panely genů

ViennaLab NGS panely jsou určeny pro diagnostické a výzkumné laboratoře zaměřené na onkologii a na identifikaci zárodečných a somatických aberací s klinickým významem ve vzorcích biopsií. Vysoce kvalitní knihovny jsou generovány hybrid-capture target enrichment protokolem a lze je sekvenovat na různých přístrojích Illumina. Pracovníci laboratoře mohou provádět sekundární a terciární analýzu sami pomocí našeho webového nástroje vybaveného interaktivním grafickým uživatelským rozhraním a optimalizovanými bioinformatickými pipelinami připravenými k použití (zahrnuty v ceně kitu).

Více o onkologických panelech genů
 

Analýza mikrobiomu

Složení a rozmanitost lidského střevního mikrobiomu souvisí s širokou škálou fenotypů v oblasti zdraví a nemocí. Cílené sekvenování variabilních oblastí v genu 16S rRNA poskytuje rychlý a snadný způsob hodnocení bakteriálního složení v lidském střevě. Test ViennaLab 16S Microbiome NGS Assay ve spojení s ViennaLab Microbiome Analysis Webtool nabízí výkonné komplexní řešení kombinující přípravu knihovny s bioinformatickou analýzou. Statistiky rozmanitosti, informativní souhrnné tabulky a grafický výstup jsou generovány s cílem usnadnit rychlý přehled a komplexní vyhodnocení složení bakterií v analyzovaných vzorcích.

NGS produkty pro analýzu střevních mikrobiomů
 

fastGEN

Personalizovaná terapie může pro pacienty s různými druhy závažných nádorových onemocnění znamenat velkou naději na prodloužení a zkvalitnění života. Informace o mutačním statusu genů KRAS, NRAS, BRAF, EGFR, H3F3A, IDH 1/2, POLE/CTNNB1, BCR::ABL1 a dalších je vyžadována pro indikaci správné terapie metastatických karcinomů a pro posouzení prognózy onemocnění. BioVendor vyvinul uživatelsky přívětivé diagnostické soupravy NGS s vynikajícími analytickými parametry a extrémně rychlým zpracováním pro laboratoře jakékoli velikosti. Technologie fastGEN je jednoduchá, ultracitlivá, specifická a účinná – dokonale se hodí k diagnostice. S reagenciemi připravenými ihned k použití, uživatelsky přívětivým pracovním postupem a komplexním řešením pro analýzu bioinformatických dat nabízí technologie fastGEN nové výhody pro klinický materiál. 

Více o fastGEN produktech

Software pro bioinformatickou analýzu: GENOVESA

Analýza genetických dat NGS může být náročným úkolem, který často vyžaduje specializované počítačové dovednosti uživatele. Vyvinuli jsme náš vlastní webový software pro bioinformatickou analýzu - GENOVESA jako řešení, které je bez námahy dostupné pro každého.  

GENOVESA je intuitivní a snadno se používá. Začátečníkům v oblasti analýzy NGS umožňuje rychlé a snadné generování relevantních informací o jejich NGS datech, aniž by potřebovali vlastní specializované bioinformatické odborníky. Na druhou stranu GENOVESA umožňuje zkušeným uživatelům upravovat a měnit parametry, používat složitá pravidla filtrování a vizuálně vyhodnocovat varianty na úrovni jednotlivých čtení.  

Aplikace GENOVESA je nezbytnou součástí testů NGS společnosti ViennaLab a je součástí každé zakoupené soupravy, například testu NGS Hereditary Cancer, testu NGS Somatic Mutations a testu NGS CES.    

GENOVESA je také nezbytnou součástí souprav fastGEN společnosti BioVendor MDx a je součástí každé zakoupené soupravy, například soupravy fastGEN Solid Cancer, soupravy fastGEN Lung Cancer, soupravy fastGEN Brain Cancer, soupravy fastGEN POLE/CTNNB1 Cancer a dalších.

GENOVESA je cloudový software pro sekvenování nové generace (Next-Generation Sequencing - NGS), který klade důraz na zabezpečení dat prostřednictvím šifrování HTTPS. Nevyužíváme poskytovatele třetích stran, jako jsou Google nebo Amazon, ale hostujeme vaše data v našem bezpečném datovém centru v Praze (Česká republika). Můžete se tak spolehnout na to, že pečlivě chráníme genetická data a neshromažďujeme žádné citlivé údaje o pacientech - v GENOVESA je možné nahrávat pouze soubory FASTQ.

Klíčové vlastnosti:

Prohlédnout software GENOVESA

Zajímá vás více?

Obraťte se na našeho produktového manažera.

Birgit Altenbacher, Ph.D.
Marketing Manager

+43 1 8120156
marketing@viennalab.com

Birgit Luef, Ph.D. - Marketing Manager for NGS, BioVendor Group
Zajímá vás více?

Obraťte se na našeho produktového manažera.

Iveta Tóthová, Ph.D.
Product & Scientific Manager

+420 724 873 015
tothova@biovendor-mdx.com

Iveta Tóthová, Ph.D.

Další projekty

Microblot-Array

Microblot-Array

Nová generace unikátního imunoblotového testu pro efektivní multiplexovou diagnostiku.

Technologie mikrotitračních destiček otevírá cestu k automatizaci a vysoké propustnosti testování. Kombinace readeru a pokročilého softwaru poskytuje komplexní výsledky a možnost napojení na laboratorní informační systém.

Objevit více
microRNA

microRNA

Inovativní metody pro kvantifikaci biomarkerů nové generace.

Široké spektrum expresních panelů a cílených měření pro jednotlivé miRNA na principu imunoblotu nebo qPCR. Komplexní řešení každého projektu, od izolace RNA až po analýzu vzorku.

Objevit více
CLIA

CLIA

Plně automatizované řešení CLIA.

Atraktivní portfolio inovativních i zavedených diagnostických parametrů v kombinaci s nejmodernějším CLIA analyzátorem tvoří komplexní, plně automatický systém pro každou diagnostickou laboratoř. Verzatilní, rychlé, plynulé, intuitivní – to je řešení CLIA od BioVendor Group.

Objevit více
LAMP

LAMP

Revoluce v plošném testování.

LAMP (Loop Mediated Isothermal Amplification) je vysoce citlivá, spolehlivá, rychlá a efektivní metoda amplifikace a detekce nukleových kyselin. Kity na principu LAMP lze aplikovat přímo na primární vzorek, stěr ve vhodném médiu, a redukovat tak počet pipetovacích kroků. Výsledky analýzy jsou k dispozici během 30 – 40 minut. 

Objevit více
Nahoru